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深圳特区主干道高速公路上发生了一起抢劫案，劫匪在客车里浇满了汽油，威逼乘客交出钱财。混乱中客车发生爆炸，司机和一名老人当场死亡，劫匪抢走了一只手提箱。此案震惊中国内外，东平市决定成立成立全国唯一一支交警队伍中的刑警中队--雷霆纵横大队刑警中队，来对付日益猖獗的路霸团伙。 丢失手提箱的人没有报案，劫匪在高速公路继续做案与警察发生冲突，劫匪一死一伤，受伤的劫匪在转院途中被人杀死。但警方却掌握了路霸团伙的线索，不料路霸团伙的成员一个接一个地死掉，最后连团伙头目也被人杀死并肢解。案件陷入了僵局，警方的注意力又重新回到了那只没报案的箱子上。故事发生在1942年，珍贵的北京猿人头盖骨化石在战乱中失去了踪迹，而日本特务则盯上了参与研究的考古学教授司须和他的女儿司文，汉奸武元收钱办事，很快就寻获了父女两人的下落，然而，正当他准备行动之时，司须因病过世，而司文亦被身份不明人士接走保护了起来。 救了司文的是一位名叫林放的男子，他的真实身份是一名中共地下党员，为的是不让国家文物落入敌寇的手中。日寇下令关闭了城门，而林放决定无论如何也要护送司文安全出城，两方人马展开了体力与智力的较量。最终，林放还是遭到了敌方的逮捕，遭到了残酷的对待，与此同时，美国文化特务亦牵扯了进来，使得司文的境况十分不利。。李志超（周润发 饰）个性沉着稳重，是可以信任的所在，周强（狄龙 饰）行事向来风风火火，对罪犯毫不留情，然而，个性上的截然相反并没能阻止两人成为相互信赖的同时兼好友。多年以前，正是周强的精明强干令大毒枭姚达（徐少强 饰）锒铛入狱，如今，姚达即将出狱，而周强的搭档却死于非命，这两件事情的发生令人不得不怀疑其中必有关联。 在姚达的精心策划之下，悲愤的周强惨遭陷害受到了警局的处分，不仅如此，他的性命还时时遭受着姚达所派出的冷酷杀手的威胁，与此同时，李志超遇见了名为潘妮（恬妞 饰）的美丽女子，此人恰恰正是姚达的情人。在黑暗笼罩的天空之下，一场正义与邪恶的恶战一触即发。。